Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms