Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac10Q6P3E7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac10Q6P3E7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms