Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms