Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms