Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11bQ6DFW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms