Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms