Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms