Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Sdc3Q64519 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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