Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl12Q62401 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl12Q62401 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms