Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf6Q62311 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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