Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms