Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms