Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms