Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhocQ62159 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms