Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Npm1Q61937 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms