Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms