Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms