Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms