Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamb3Q61087 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms