Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Als2clQ60I26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Als2clQ60I26 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2clQ60I26 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms