Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms