Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms