Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip3Q60769 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms