Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms