Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm1Q60636 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms