Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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