Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Utp18Q5SSI6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Utp18Q5SSI6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Utp18Q5SSI6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Utp18Q5SSI6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Utp18Q5SSI6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp18Q5SSI6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms