Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RilpQ5ND29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms