Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms