Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5431Q5NCB3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms