Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms