Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms