Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms