Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc185Q3V118 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Ccdc185Q3V118 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc185Q3V118 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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