Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm44Q3V089 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms