Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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