Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms