Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms