Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms