Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms