Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acsf3Q3URE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acsf3Q3URE1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Acsf3Q3URE1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms