Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms