Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctsll3Q3ULP7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctsll3Q3ULP7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms