Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms