Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms