Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm45902Q3UDN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm45902Q3UDN3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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