Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CenplQ3U3S3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenplQ3U3S3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms