Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gse1Q3U3C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms