Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf149Q3U2C5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf149Q3U2C5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf149Q3U2C5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf149Q3U2C5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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