Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy4Q3TYX8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms